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杨志辉
BiTransDPI
Commits
07160eb6
提交
07160eb6
authored
6月 16, 2021
作者:
朱学凯
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浏览文件
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电子邮件补丁
差异文件
add mol_test
上级
e5d444a3
隐藏空白字符变更
内嵌
并排
正在显示
2 个修改的文件
包含
36 行增加
和
8 行删除
+36
-8
dataset.py
dataset.py
+17
-0
test.py
test.py
+19
-8
没有找到文件。
dataset.py
浏览文件 @
07160eb6
...
...
@@ -260,6 +260,23 @@ def get_task(task_name):
}
return
df_train
,
tokenizer_config
elif
task_name
.
lower
()
==
'test_mol'
:
df_test
=
{
"sps"
:
'./data/test/test_sps'
,
'seq'
:
'./data/test/test_protein_seq'
,
"smile"
:
'./data/test/test_smile'
,
"affinity"
:
'./data/test/test_ic50'
,
}
tokenizer_config
=
{
"vocab_file"
:
'./config/vocab_mol.txt'
,
"vocab_pair"
:
'./config/drug_codes_chembl.txt'
,
"vocab_pair_p"
:
'./config/protein_codes_uniprot.txt'
,
"begin_id"
:
'[CLS]'
,
"separate_id"
:
"[SEP]"
,
"max_len"
:
595
}
return
df_test
,
tokenizer_config
if
__name__
==
"__main__"
:
...
...
test.py
浏览文件 @
07160eb6
from
transformers
import
BertTokenizer
from
modeling_bert
import
BertForMaskedLM
import
torch
import
numpy
as
np
from
PIL
import
Image
import
os
a
=
np
.
ones
((
5
))
img_1_path
=
"E:
\
FIVN论文
\
照片
\
朱学凯.jpeg"
filename
=
"E:
\
FIVN论文
\
照片
\
朱学凯_gray.jpeg"
b
=
a
[:
4
]
print
(
'----------------'
)
\ No newline at end of file
def
RGBtoGray
(
path
,
save
):
# files = os.listdir(path)
# for file in files:
# imgpath = path + '/' + file
# #print(imgpath)
#
img
=
Image
.
open
(
path
)
.
convert
(
'L'
)
#resize将图像像素转换成自己需要的像素大小
# img = im.resize((512, 512))
# dirpath = filename
# file_name, file_extend = os.path.splitext(f)
# dst = os.path.join(os.path.abspath(dirpath), file_name + '.jpg')
img
.
save
(
save
)
if
__name__
==
"__main__"
:
RGBtoGray
(
img_1_path
,
filename
)
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